近日，農(nóng)業(yè)農(nóng)村部組織開展國家種業(yè)陣型企業(yè)遴選工作，華大基因（300676）同時(shí)入選為國家農(nóng)作物、畜禽、水產(chǎn)種業(yè)專業(yè)化平臺(tái)陣型企業(yè)。該遴選根據(jù)企業(yè)創(chuàng)新能力、資產(chǎn)實(shí)力、市場規(guī)模、發(fā)展?jié)摿Φ惹闆r綜合評(píng)選。
《農(nóng)業(yè)農(nóng)村部辦公廳關(guān)于扶持國家種業(yè)陣型企業(yè)發(fā)展的通知》顯示，扶持種業(yè)陣型企業(yè)，形成優(yōu)勢種業(yè)企業(yè)集群，是實(shí)現(xiàn)“種業(yè)科技自立自強(qiáng)、種源自主可控”的關(guān)鍵一招。
(資料圖片)
“一粒種子改變一個(gè)世界”，農(nóng)業(yè)種質(zhì)資源是保障國家糧食安全與重要農(nóng)產(chǎn)品供給的重要資源，是農(nóng)業(yè)科技原始創(chuàng)新與現(xiàn)代種業(yè)發(fā)展的物質(zhì)基礎(chǔ)。
近年來，隨著育種研究的深入，數(shù)據(jù)庫技術(shù)與常規(guī)遺傳育種相結(jié)合，研究各種優(yōu)良基因的多樣性和遺傳特點(diǎn)，為新基因在育種中的應(yīng)用提供科學(xué)依據(jù)，越來越多研究表明，種質(zhì)資源是未來育種的基石。
聚焦種質(zhì)資源保護(hù)與開發(fā)，華大基因旗下華大科技提出“種質(zhì)資源研究 → 多組學(xué)數(shù)據(jù) → 分析 → 數(shù)據(jù)庫 → 分子創(chuàng)新育種”的整體解決方案，為提高分子育種效率、加大種質(zhì)資源及數(shù)據(jù)信息共享力度提供基礎(chǔ)支撐。
01
研究思路
種質(zhì)資源研究方案如下圖所示：
種質(zhì)資源研究方案（具體以實(shí)際執(zhí)行方案為準(zhǔn)）
02
案例分享
進(jìn)入群體基因組時(shí)代，華大基因和科研伙伴同樣有不少舉足輕重的產(chǎn)出。
其中，2021年11月，國際半干旱熱帶作物研究中心和華大基因等單位合作的全球3,366份鷹嘴豆種質(zhì)資源測序計(jì)劃文章發(fā)表于Nature[2]，該項(xiàng)目產(chǎn)生測序數(shù)據(jù)29T，平均測序深度12X，構(gòu)建了一個(gè)較為完善的鷹嘴豆泛基因組，得到了迄今最為廣泛的鷹嘴豆遺傳變異圖譜，揭示了鷹嘴豆的起源和馴化，闡釋了基因組輔助育種方法在鷹嘴豆上的應(yīng)用和實(shí)踐。
鷹嘴豆泛基因組
通過栽培鷹嘴豆和野生祖先的比較分析，研究人員發(fā)現(xiàn)了導(dǎo)致作物品種衰減的有害基因，而深入分析地方品種，研究人員鑒定得到了決定鷹嘴豆的產(chǎn)量、氣候適應(yīng)性、種子特性等重要農(nóng)藝性狀的優(yōu)勢單倍型。進(jìn)一步地，針對(duì)16個(gè)重要農(nóng)藝性狀，研究人員提出了三種基于全基因組數(shù)據(jù)的預(yù)測方法來預(yù)測鷹嘴豆的生產(chǎn)能力，并證明了這些方法可以提高“百粒重”這一個(gè)關(guān)鍵的產(chǎn)量性狀，并預(yù)測增加12%到23%。
以此為基礎(chǔ)構(gòu)建的鷹嘴豆遺傳變異數(shù)據(jù)庫CicerSeq是迄今為止最大的鷹嘴豆全球遺傳多樣性數(shù)據(jù)庫，覆蓋了全球當(dāng)前已經(jīng)搜集整理的大約八萬份所有鷹嘴豆種質(zhì)中的核心部分。
全球鷹嘴豆遺傳變異數(shù)據(jù)庫
圖源：https://cegresources.icrisat.org/cicerseq/
多年來，華大基因與科研伙伴一直深耕于動(dòng)植物研究領(lǐng)域。旗下華大科技作為全球領(lǐng)先的科學(xué)技術(shù)服務(wù)機(jī)構(gòu)，主導(dǎo)和參與了許多大規(guī)模動(dòng)植物種質(zhì)資源研究計(jì)劃，在種質(zhì)資源的測序和分析方面積累了大量經(jīng)驗(yàn)。
華大參與部分種質(zhì)資源研究案例展示
隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展和成本的下降，動(dòng)植物基因組研究日益深入。華大基因一直致力于為廣大科研人員提供基因組De novo和重測序一站式服務(wù)，在種質(zhì)資源保護(hù)、新品種選育等方面貢獻(xiàn)力量，助推現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究進(jìn)程。
華大科技服務(wù)優(yōu)勢
提取能力強(qiáng)，測序質(zhì)量好：已成功執(zhí)行各種類型的物種的建庫和測序，嚴(yán)格質(zhì)控；
通量高可量產(chǎn)：效果好；
一站式全流程服務(wù)：從樣本到結(jié)果，提供切實(shí)可行的全流程服務(wù)；
項(xiàng)目方案支持：大項(xiàng)目依據(jù)樣本情況和研究目的參與方案設(shè)計(jì)；
專業(yè)團(tuán)隊(duì)，實(shí)力雄厚：博士級(jí)別專業(yè)團(tuán)隊(duì)支持；
經(jīng)驗(yàn)豐富：華大基因已經(jīng)成功完成1,000多個(gè)物種的全基因組從頭測序，合作發(fā)表頂級(jí)期刊文章200+，其中28篇為封面文章；動(dòng)植物重測序領(lǐng)域，華大累計(jì)發(fā)文200+篇，DNBSEQ 相關(guān)文章100+篇，影響因子1,000+；IF>20文章17篇。
